2014-07-24 Artykuł

Rola modelowania molekularnego w procesie poszukiwania nowych substancji chemicznych o potencjalnym znaczeniu terapeutycznym

Szybki rozwój komputerów oraz oprogramowania sprawił, że metody informatyczne in silico stały się integralną częścią procesu poszukiwania i projektowania nowych leków, intensywnie wspieraną przez przemysł farmaceutyczny. Za pomocą dostępnego obecnie oprogramowania do modelowania molekularnego możliwa jest analiza i porównywanie struktur, projektowanie związków wiodących, identyfikowanie konformacji aktywnej liganda i farmakoforu, analizowanie sposobu łączenia się liganda z receptorem oraz wiele innych. Zastosowanie metod i narzędzi obliczeniowych w procesie projektowania leków jest interesującą alternatywą, która pozwala na znaczną redukcję czasu i kosztów związanych z wprowadzeniem na rynek nowego leku.

  Czytaj pełny tekst

Autor: mgr Roksana Wałęsa, dr hab. Małgorzata A. Broda

Data publikacji: 2014-07-24

Źródło: Lek w Polsce 6/2014

Słowa kluczowe: modelowanie molekularne, projektowanie leków in silico

1. http://www.forbes.com/sites/matthewherper/2013/08/11/the-cost-ofinventing- a-new drug-98-companies-ranked/

2. Ooms F, Molecular Modeling and Computer Aided Drug Design. Examples of their Applications in Medicinal Chemistry, Curr Med Chem 2000; 7:141- 158.

3. Kurczab R, Projektowanie leków in silico, Przemysł Farmaceutyczny 2011; 1:32–34.

4. Polak S, Wiśniowska B, Modelowanie komputerowe w badaniach nad lekiem – projektowanie i poszukiwanie cząstki aktywnej, ocena właściwości fizykochemicznych oraz aktywności biologicznej, Farmacja Polska 2009; 65(3):214-223.

5. Maggiora GM, Is there a future for computational chemistry in drug research? J Comput Aided Mol Des 2012; 26:87–90.

6. Bajorath J, Computational chemistry in pharmaceutical research:at the crossroads, J Comput Aided Mol Des 2012; 26:11–12.

7. Kenny PW, Computation, experiment and molecular design, J Comput Aided Mol Des 2012; 26:69–72.

8. Buyya R, Branson K, Giddy J i wsp. The Virtual Laboratory: a toolset to enable distributed molecular modelling for drug design on the World-Wide Grid, Concurrency Computat.: Pract. Exper 2003; 15:1–25.

9. Moonsamy S, Soliman MES, Dual acting HIV inhibitors: integrated rational in silico design strategy, Med Chem Res, 2014; 23:682–689.

10. Nadendla RR, Molecular Modeling: A Powerful Tool for Drug Design and Molecular docking, Resonance, 2004; 51–60.

11. Ritchie TJ, McLay IM, Should medicinal chemists do molecular modelling? Drug Discov Today 2012; 17:535–537.

12. Mandal S, Moudgil M, Mandal SK, Rational drug design, Eur J Pharmacol 2009; 625:90–100.

13. Bodera P, Tworzenie nowych leków: miejsca docelowe i receptory, Czasopismo Aptekarskie 2009; 1(181):13-20.

14. Patrick G. L. Chemia leków – Krótkie wykłady, PWN, Warszawa 2004.

15. Patrick G. L. Chemia medyczna – Podstawowe zagadnienia, Wydawnictwo Naukowo Techniczne, Warszawa 2003.

16. Silverman R.B., Chemia organiczna w projektowaniu leków, Wydawnictwo Naukowo Techniczne, Warszawa 2004.

17. Friedman R, Boye K, Flatmark K, Molecular modelling and simulations in cancer research, Biochim Biophys Acta 2013; 1836:1–14.

18. Barril X, Luque FJ, Molecular simulation methods in drug discovery: a prospective outlook, J Comput Aided Mol Des 2012; 26:81–86.

19. Kitchen DB, Decornez H, Furr JR i wsp. Docking and scoring in virtual screening for drug discovery: methods and applications, Nat Rev Drug Discov 2004; 3:935–949.

20. Hensen C, Hermann JC, Nam K i wsp. J Med Chem 2004; 47:6673– 6680.

21. Messaoudi A, Belguith H, Hamida JB, Homology modeling and virtual screening approaches to identify potent inhibitors of VEB-1 β-lactamase, Theor Biol Med Model 2013; 10:22-32.

22. Bassetto M, Burghgraeve TD, Delang L i wsp. Computer-aided identification, design and synthesis of a novel series of compounds with selective antiviral activity against chikungunya virus, Antiviral Res. 2013; 98:12–18.

23. http://www.biomodellab.eu/biomodeling/docs/lecture/CADD_SF_4_2013.pdf

POWRÓT
reklama Baner_prawy_ZALOGU-SIE
...
Info
Najczęściej czytane
Redaktor poleca
GP

Na skróty

Informacje

Copyright © Medyk sp. z o.o